用于GPU的基因組測序軟件幫助研究人員更快了解新型冠狀病毒。

當危機襲來時，每個人都需全力以赴地應對危機。為應對此次新型冠狀病毒疫情，NVIDIA為研究人員們提供了相關工具，使他們能夠更快地了解COVID-19，并有助于研究應對措施。

自今日起，NVIDIA將向全球所有新型冠狀病毒研究人員免費提供90天的Parabricks使用權(quán)。Parabricks基于著名的Genome Analysis Toolkit，可通過GPU將序列數(shù)據(jù)分析速度提高50倍。

我們認識到此次疫情正在不斷變化，因此我們將密切關注疫情并根據(jù)需要提供更多的支持。

如果您可以使用NVIDIA GPU，請?zhí)顚懘吮砩暾圥arabricks使用權(quán)。

使用Oxford Nanopore long-read數(shù)據(jù)的研究人員可在GitHub上找到GPU加速工具存儲庫。此外，以下應用已內(nèi)置NVIDIA GPU加速功能：Medaka、Racon、Raven、Reticulatus和 Unicycler。

目前，研究人員正在對新型冠狀病毒和COVID-19感染者的基因組進行測序，以了解疾病的傳播方式并確定易感染人群。但分析基因組序列需要耗費大量的時間和計算力。

長期以來，加速科學研究始終都是NVIDIA的核心使命之一。 Parabricks團隊于去年12月加入NVIDIA，為此項工作提供了最新的工具。它可以在一臺服務器上快速分析一個人的全部基因組變異，將分析時間從幾天縮短至一個小時以內(nèi)。

鑒于此次疫情史無前例的傳播速度，將獲得結(jié)果的時間從數(shù)天縮短至數(shù)小時能夠?qū)α私獠《具M化和疫苗開發(fā)產(chǎn)生巨大的推動作用。

NVIDIA正在邀請我們的合作伙伴與我們一同開展這項迫在眉睫的工作，為研究人員提供幫助。我們正在與云服務供應商和超級計算中心討論在他們的平臺上提供計算資源和Parabricks訪問。

隨著有更多資源可供使用，我們將更新本文中的相關鏈接，以提供NVIDIA GPU和本軟件的云端訪問。