新型冠狀病毒肺炎(Corona Virus Disease 2019,COVID-19,簡(jiǎn)稱“新冠肺炎”),是由SARS-CoV-2冠狀病毒引起的一種傳染性疾病。新冠肺炎自2019年12月在中國(guó)武漢首次出現(xiàn)以來(lái),疫情規(guī)模在全球范圍內(nèi)迅速擴(kuò)大。2020年3月11日,世界衛(wèi)生組織總干事譚德塞宣布,根據(jù)評(píng)估,世衛(wèi)組織認(rèn)為當(dāng)前新冠肺炎疫情可被稱為全球大流行(pandemic)。到了2020年4月,全球新冠肺炎確診病例已超過(guò)200萬(wàn)例,致使許多國(guó)家的經(jīng)濟(jì)陷入停滯。
診斷測(cè)試可能是了解SARS-CoV-2在時(shí)間和空間上傳播的唯一有效方法,幫助決策者和醫(yī)療工作者跟蹤并控制COVID-19的爆發(fā)。世衛(wèi)組織呼吁全球進(jìn)行大規(guī)模檢測(cè)。據(jù)估計(jì),COVID-19的全球檢測(cè)需求量超過(guò)6億次,其中包括1.2億次基因檢測(cè)和超過(guò)5億次快速檢測(cè)。
全球大規(guī)模測(cè)試需求,推動(dòng)了COVID-19診斷技術(shù)的創(chuàng)新競(jìng)爭(zhēng)。英國(guó)知名研究機(jī)構(gòu)IDTechEx在本報(bào)告中深入調(diào)研了COVID-19診斷技術(shù),全面分析了能夠快速獲得COVID-19診斷結(jié)果以應(yīng)對(duì)全球大流行的技術(shù)創(chuàng)新。
從病毒中(RNA或DNA,或蛋白質(zhì))提取分子是實(shí)現(xiàn)診斷的基礎(chǔ),也是開(kāi)發(fā)新療法和疫苗的必要條件。根據(jù)目標(biāo)生物標(biāo)記物,診斷方法可分為兩類:基因檢測(cè)(檢測(cè)病毒基因組),以及血清學(xué)和抗原檢測(cè)(分別檢測(cè)抗體和病毒抗原)。從技術(shù)角度來(lái)看,分子診斷(MDx)和側(cè)向流動(dòng)檢測(cè)(LAFs)主導(dǎo)了COVID-19的診斷。臨床實(shí)驗(yàn)室使用的黃金標(biāo)準(zhǔn)是定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR,MDx),而這需要中心實(shí)驗(yàn)室環(huán)境。這種qRT-PCR檢測(cè)持續(xù)時(shí)間超過(guò)2小時(shí),從樣本傳送到得到結(jié)果最多可能需要數(shù)日。隨著社區(qū)應(yīng)用場(chǎng)景對(duì)更快測(cè)試的需求,市場(chǎng)正在轉(zhuǎn)向即時(shí)檢測(cè)(POC)設(shè)備,包括POC MDx和POC LFAs。
COVID-19診斷方法
所有檢測(cè)病毒基因組的分子診斷試驗(yàn)都有三個(gè)共同步驟:從鼻咽拭子采集樣本,提取病毒RNA,擴(kuò)增分析物并讀出。通過(guò)RT-PCR可以高可靠地執(zhí)行擴(kuò)增步驟,不過(guò),也有不需要昂貴大型設(shè)備的替代方法,例如等溫?cái)U(kuò)增。這種方法的靈敏度雖然比PCR低,但可以在恒定溫度下加快擴(kuò)增步驟。
COVID-19生物標(biāo)記物
通常通過(guò)樣品中的熒光探針和qRT-PCR裝置中的檢測(cè)器來(lái)讀出擴(kuò)增信號(hào)。許多公司采用了LFAs以及其它需要專用檢測(cè)設(shè)備的讀出方法。MDx的高特異性和靈敏度,以及LFAs的速度和低成本使這類“混合系統(tǒng)”受益。
本報(bào)告指出了診斷生態(tài)系統(tǒng)中目前正在開(kāi)發(fā)的關(guān)鍵創(chuàng)新和技術(shù)趨勢(shì),這些創(chuàng)新和趨勢(shì)將使COVID-19能夠在即時(shí)檢測(cè)環(huán)境下進(jìn)行快速、靈敏的診斷:
除了基因檢測(cè),抗原檢測(cè)和血清學(xué)檢測(cè)(即所謂的“快速檢測(cè)”)也正在成為抗擊疫情大流行的重要工具。這兩種免疫分析都依賴于抗體抗原識(shí)別。
COVID-19主要診斷設(shè)備對(duì)比分析
分子診斷是COVID-19診斷的核心
在中國(guó)研究人員公布SARS-CoV-2基因組序列幾天后,該病毒的早期分子診斷試劑就研制出來(lái)了。最早開(kāi)發(fā)出來(lái)的是世界各地的公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu),如Charité(柏林)和美國(guó)疾病控制和預(yù)防中心(CDC),以及一些商業(yè)醫(yī)藥公司。它們都是基于定量反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)技術(shù),在引物設(shè)計(jì)及其它方面略有不同。
世衛(wèi)組織在2020年1月公布了SARS-CoV-2檢測(cè)規(guī)程,許多國(guó)家也制定了自己的檢測(cè)方案。在COVID-19爆發(fā)兩個(gè)月后,多家廠商開(kāi)發(fā)出了可在中心實(shí)驗(yàn)室外便攜部署的即時(shí)分子診斷(POC-MDx)設(shè)備。他們提供的qRT-PCR檢測(cè),從拿到樣本到出結(jié)果的時(shí)間不到一小時(shí)。
可用于COVID-19診斷的qRT PCR檢測(cè)試劑盒(部分)
美國(guó)廠商領(lǐng)導(dǎo)了COVID-19分子診斷測(cè)試
超過(guò)36%的COVID-19測(cè)試供應(yīng)商來(lái)自美國(guó),29%來(lái)自中國(guó),14%來(lái)自韓國(guó)。美國(guó)公司也主導(dǎo)了RNA提取、試劑盒以及設(shè)備的供應(yīng)。中韓兩國(guó)由于COVID-19的早期爆發(fā)以及國(guó)內(nèi)需求的增加,兩國(guó)的廠商開(kāi)發(fā)并生產(chǎn)了大量的測(cè)試產(chǎn)品。他們開(kāi)始向歐洲和世界其它地區(qū)出口大量的qRT-PCR檢測(cè)試劑盒。盡管歐洲制造MDx試劑盒的公司數(shù)量不多(不到20家),但由于羅氏(Roche)等生物技術(shù)巨頭的存在,該地區(qū)的產(chǎn)能很高。
除了生物技術(shù)領(lǐng)域的努力,多家軟件公司還開(kāi)發(fā)了算法,用于在患者CT掃描成像中識(shí)別與COVID-19相關(guān)的肺炎癥狀。CT成像是檢測(cè)COVID-19感染的一種有效方法,圖像識(shí)別AI算法可以比放射科醫(yī)生更快、更高效地識(shí)別這些異常。
在這份報(bào)告中,IDTechEx對(duì)各種技術(shù)方案的100多種商業(yè)診斷設(shè)備進(jìn)行了對(duì)比分析,幫助讀者深入了解圍繞COVID-19全球響應(yīng)的技術(shù)趨勢(shì)和生物技術(shù)創(chuàng)新。
責(zé)任編輯:pj
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