麻省理工學(xué)院的研究人員已經(jīng)認(rèn)識(shí)到免疫系統(tǒng)破譯病毒的方式與人們通過(guò)語(yǔ)言理解彼此思想的方式之間的相似之處。
在《科學(xué)》雜志上發(fā)表的研究報(bào)告中,研究小組詳細(xì)介紹了如何將這些并行通信方式背后的原理與AI結(jié)合使用,以預(yù)測(cè)某些病毒(包括SARS-CoV-2)的哪些變異株將變得危害最大。
研究人員認(rèn)為,這樣的預(yù)測(cè)可以幫助指導(dǎo)現(xiàn)有疫苗的改進(jìn)。這樣做的目的是避免嚴(yán)重的聚集威脅,而又不會(huì)因不太可能擴(kuò)散的菌株而散發(fā)氣味。
病毒突變成免疫系統(tǒng)無(wú)法識(shí)別的毒株的過(guò)程稱為病毒逃逸。
在本文中,生物工程師Bryan Bryson博士,計(jì)算機(jī)科學(xué)家Bonnie Berger博士及其合著者描述了他們的工作模型,該工作模型是使用最初為自然語(yǔ)言處理開發(fā)的AI算法對(duì)病毒逃逸進(jìn)行建模的。
NLP系統(tǒng)旨在處理語(yǔ)法(即句子或從句構(gòu)造)和語(yǔ)義(即含義)。
對(duì)于病毒逃逸預(yù)測(cè)項(xiàng)目,研究人員在數(shù)千種刺突蛋白的遺傳序列上訓(xùn)練了他們的實(shí)驗(yàn)系統(tǒng),如今對(duì)它們的藝術(shù)描繪已無(wú)處不在。為了使模型區(qū)分COVID-19與感冒或流感病毒,訓(xùn)練集包括SARS-CoV-2以外的冠狀病毒的尖峰。
“這些病毒的語(yǔ)義格局預(yù)測(cè)了病毒逃逸突變,這些突變產(chǎn)生的句法和/或語(yǔ)法正確,但實(shí)際上在語(yǔ)義上有所不同,因此能夠逃避免疫系統(tǒng),”布賴森及其合著者解釋說(shuō)?!拔覀儗⑻颖芡蛔冏R(shí)別為保留病毒感染性但導(dǎo)致病毒看起來(lái)與免疫系統(tǒng)不同的突變,類似于保留句子語(yǔ)法但改變其含義的單詞更改?!?/p>
在對(duì)話覆蓋率由工作IEEE頻譜,合著者布賴恩枝,在麻省理工學(xué)院的博士生說(shuō),他希望該模型將最終能夠出現(xiàn)之前預(yù)測(cè)的病毒突變。
Hie說(shuō):“這是該研究領(lǐng)域的月球目標(biāo):為未來(lái)形式的病毒接種疫苗?!?/p>
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