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人工智能提前五年預(yù)測乳腺癌,讓疾病無所遁形!

Hf1h_BigDataDig ? 來源:YXQ ? 2019-07-09 10:28 ? 次閱讀
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對乳腺癌的早期篩查一直是機器學(xué)習(xí)的一個熱門研究方向,可是已有的篩查模型大多數(shù)依賴于白人女性樣本,因此對于非白人女性的篩查準(zhǔn)確率令人堪憂。

最近麻省理工開發(fā)的新模型不僅很好地解決了這個問題,而且還能夠提前五年篩查出乳腺癌病患!

這一項突破性研究,標(biāo)志著深度學(xué)習(xí)技術(shù)推動下的醫(yī)學(xué)進步,可以提前了解病情,做針對性治療,這對于病患來說,是一大福祉。

Regina Barzilay和Lehman與CSAIL博士生的主要作者Adam Yala共同撰寫了這篇論文。

已有的篩查模型

之前的疾病篩查模型大多是CNN(卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò))的改良版本,CNN是前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò),模擬人的視覺對于圖像的理解。網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)中的卷積核提取圖像的邊緣、輪廓等信息,Relu等激活函數(shù)模擬大腦對于外界信號刺激的應(yīng)答,對提取到的圖像信息做整合,淺層卷積層提取到局部的圖像信息,層數(shù)越深的卷積層能提取到全局的圖像信息,在CV(Computer Version)領(lǐng)域也稱為感受野(Receptive Field),CNN網(wǎng)絡(luò)模型對于圖像的分類任務(wù)處理十分友好,下圖很好地展示了CNN網(wǎng)絡(luò)的結(jié)構(gòu)和原理:

CNN圖像理解示意圖

疾病篩查任務(wù)也就是二分類任務(wù),對于輸入的圖像,需要得到是否患病的判斷。給醫(yī)學(xué)圖片做標(biāo)簽(在計算機科學(xué)中標(biāo)記為0或1,0表示沒有患病,1表示患?。?,在模型中,通過Label(標(biāo)記)好圖片的訓(xùn)練和反向傳播的參數(shù)調(diào)整,使得模型具備一定的學(xué)習(xí)能力,最終能夠?qū)ξ礃?biāo)記的醫(yī)學(xué)圖片做疾病篩查。但是訓(xùn)練的結(jié)果依靠數(shù)據(jù)集的好壞,已有的很多乳腺癌預(yù)測數(shù)據(jù)集都偏向于白人女性的研究,鮮少考慮到其他族裔。麻神理工大學(xué)研究人員開發(fā)的診斷模型考慮到了這一點。

將研究擴展到少數(shù)族裔

麻省理工的研究人員在一篇博客中指出,事實上這個看起來不起眼的一個細節(jié)是乳腺癌預(yù)測的關(guān)鍵:因為黑人女性死于乳腺癌的概率比白人女性高 42%。而正是目前的乳腺癌早期診斷技術(shù)中對黑人女性的診斷模型缺失造成了這一巨大差異,因為包括黑人女性在內(nèi)的少數(shù)族裔樣本在已有的深度學(xué)習(xí)模型開發(fā)中通常鮮有被考慮進去。

而麻省理工的研究人員表示,他們對乳腺癌預(yù)測模型的研究正是為了彌補這一缺陷,他們希望通過這一研究提高對少數(shù)族裔健康評估的準(zhǔn)確性。針對同一個問題的研究同時也是近期很多業(yè)界公司研究和產(chǎn)品開發(fā)的重心。

模型結(jié)果表明,對于黑人和白人女性的預(yù)測效果都相當(dāng)好。

之所以強調(diào)對黑人與白人女性的效果一樣好,是因為研究人員在開發(fā)過程中發(fā)現(xiàn)同類的人工智能模型存在大量偏差——因為它們對樣本的采集嚴(yán)重地傾向白人女性,黑人女性則很少。因此來自麻省理工的研究團隊仔細地設(shè)計了他們的模型,使得它對于兩種族裔的女性都能夠很好地作出預(yù)測。

基于風(fēng)險評估的提前預(yù)測

麻省理工學(xué)院教授Regina Barzilay本人是一名乳腺癌幸存者,她表示希望這樣的系統(tǒng)能讓醫(yī)生在個人層面定制篩查和預(yù)防計劃,使得晚期診斷成為歷史。

所有性別都有患乳腺癌的風(fēng)險,而大部分人通常認(rèn)為只影響女性。自1989年第一個乳腺癌風(fēng)險模型以來,研究者發(fā)展患乳腺癌的風(fēng)險在很大程度上取決于人類的知識和對主要危險因素的直覺,如年齡、乳腺癌和卵巢癌的家族史、激素和生殖因素以及乳房密度。

然而,這些標(biāo)志物中的大多數(shù)僅與乳腺癌微弱相關(guān)。因此,這些模型在個人層面上仍然不是很準(zhǔn)確,并且鑒于這些限制,許多組織仍然認(rèn)為基于風(fēng)險的篩查計劃是不可能的。

另一方面,“自20世紀(jì)60年代以來,放射科醫(yī)生已經(jīng)注意到女性在乳房X線照片上可以看到獨特且變化很大的乳房組織模式,”Lehma說。“這些模式可以代表遺傳,激素,懷孕,哺乳,飲食,體重減輕和體重增加的影響。我們現(xiàn)在可以在個人層面的風(fēng)險評估中更準(zhǔn)確地利用這些詳細信息?!?/p>

不同于已有的預(yù)測模型,麻省理工計算機與人工智能實驗室開發(fā)出的模型準(zhǔn)確地將31%的癌癥患者置于風(fēng)險最高的類別,而傳統(tǒng)模型僅為18%,可以至多提前五年預(yù)測乳腺癌細胞發(fā)展。

數(shù)據(jù)集來源

MIT / MGH團隊不是手動識別乳房X線照片中驅(qū)動未來癌癥的模式,而是訓(xùn)練深度學(xué)習(xí)模型直接從數(shù)據(jù)中誘導(dǎo)模式。麻省理工開發(fā)的這一預(yù)測模型的開發(fā)基于超過六萬名來自麻省總醫(yī)院(Massachusetts General Hospital)的病人樣本,其中包括超過九萬份乳房X光檢查報告和病人們病情發(fā)展情況。

這一模型從這些數(shù)據(jù)出發(fā),通過深度學(xué)習(xí)甚至能夠辨識出一些人類醫(yī)生都無法辨認(rèn)出的病情。因為已有的關(guān)于乳腺癌的假設(shè)和風(fēng)險因素都充其量是一個指導(dǎo)性的判斷框架,而麻省理工的這個模型并不是基于類似的框架,因此模型的準(zhǔn)確性在預(yù)測性診斷和預(yù)篩查方面會更加準(zhǔn)確。

總結(jié)與展望

總的來說,麻省理工計算機與人工智能實驗室的這一項目旨在協(xié)助醫(yī)生們?yōu)椴∪吮M早選擇正確的治療方案,而不是像現(xiàn)在的大多數(shù)情況下一樣,在病人們的病情惡化甚至發(fā)展到晚期時才告訴他們這一殘酷的事實。

同時,最近在nature中也有報道,對于BRCA1和BRCA2基因的突變檢測也能更有效地開展乳腺癌的治療。

展望未來,來自麻省理工的團隊希望能夠用這一技術(shù)來提高其他類似疾病的預(yù)測準(zhǔn)確性,如通過掃描腦部結(jié)構(gòu),可以對阿爾茨海默病和多發(fā)性硬化癥做預(yù)測,同理也可以對心血管疾病做預(yù)測。只要針對某種疾病的研究已經(jīng)有成型的風(fēng)險模型,這一技術(shù)就有可能大大提高對它預(yù)診斷的準(zhǔn)確性。

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原文標(biāo)題:乳腺癌預(yù)測模型只有白人女性數(shù)據(jù),MIT剛剛把它擴展到了所有族裔

文章出處:【微信號:BigDataDigest,微信公眾號:大數(shù)據(jù)文摘】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請注明出處。

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