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執(zhí)行全基因組和跨基因組數(shù)據(jù)分析的能力可以大大減少新的生物發(fā)現(xiàn)所需的時間。這就提出了生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫研究中涉及數(shù)據(jù)表示和數(shù)據(jù)集成的重要問題。傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)不支持基本的生物數(shù)據(jù)類型（如序列位置）和工具（如流行的BLAST序列比對工具），這迫使研究人員反直觀地表示生物知識，并實現(xiàn)數(shù)據(jù)操作代碼。本文介紹了生物索引，一種用于表示和管理生物信息的概念性基礎(chǔ)設(shè)施，它允許在現(xiàn)代數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)中查詢這些信息。本文還描述了一個實現(xiàn)-BLASTgres，一個PostgreSQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的擴展-提供可索引的生物信息數(shù)據(jù)類型和可連接的BLAST對齊。BLASTgres中的序列位置數(shù)據(jù)類型具有特殊的意義，因為它是可索引的，對BLAST生成的序列比對信息至關(guān)重要，并且在現(xiàn)有的生物信息中普遍存在。
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