資料介紹
禁忌搜索算法是一種局部搜索能力很強(qiáng)的全局迭代優(yōu)化算法,已經(jīng)被成功地應(yīng)用到各種組合優(yōu)化問題中。基于AB 非格模型,該文將一種改進(jìn)的禁忌搜索算法應(yīng)用于蛋白質(zhì)三維折疊結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明改進(jìn)的禁忌算法求得的蛋白質(zhì)三維最低能量構(gòu)形的最低能量值比已有的算法求得的最低能量值要低,同時(shí)三維構(gòu)形中形成了一個(gè)疏水核,被親水殘基包圍,反映了真實(shí)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)特征。該算法效率高,可以有效地用于蛋白質(zhì)三維折疊預(yù)測(cè)。
關(guān)鍵詞:禁忌搜索算法;蛋白質(zhì)三維折疊;AB 非格模型
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