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一種明場成像細(xì)胞術(shù)(BFIC)技術(shù)

微流控 ? 來源:麥姆斯咨詢 ? 作者:麥姆斯咨詢 ? 2022-06-26 10:32 ? 次閱讀
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循環(huán)腫瘤細(xì)胞(CTC)是指一組從原發(fā)性腫瘤分離并在血液中循環(huán)的稀有癌細(xì)胞。大量證據(jù)表明,CTC是標(biāo)記癌癥轉(zhuǎn)移進(jìn)展的關(guān)鍵生物標(biāo)志物。相關(guān)研究已發(fā)現(xiàn)外周血中CTC的數(shù)量與總生存期(OS)相關(guān),可被視為癌癥進(jìn)展的指標(biāo)。因此,準(zhǔn)確識(shí)別和計(jì)數(shù)CTC在癌癥診斷和有效監(jiān)測中具有重要意義。

目前,分析CTC的一個(gè)主要障礙是它們相對(duì)于大量血細(xì)胞而言極為稀有。近年來,基于明場顯微成像的細(xì)胞形態(tài)鑒定和分類方法因具有簡單、無標(biāo)記和易于獲取的優(yōu)點(diǎn),在CTC鑒定中表現(xiàn)出極大的應(yīng)用前景。然而,目前用于CTC鑒定的顯微鏡形態(tài)學(xué)方法主要依賴于載玻片上細(xì)胞的靜止成像,由于通量的限制,通過“靜止成像”方法測量的血細(xì)胞數(shù)量不足以檢測數(shù)量稀有的CTC。

據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,來自鄭州大學(xué)楊瀟楠教授課題組與中科院微電子所張文昌副研究員課題組聯(lián)合提出了一種明場成像細(xì)胞術(shù)(BFIC)技術(shù),以及多幀圖像關(guān)聯(lián)(MFIC)算法,作為一種潛在的無標(biāo)記CTC識(shí)別和計(jì)數(shù)方法。這種方法可以在連續(xù)記錄寬微流控通道中流動(dòng)細(xì)胞圖像的同時(shí)確定細(xì)胞類型,并可以很容易地與大多數(shù)現(xiàn)有的CTC富集方法相結(jié)合,使其成為具有潛力的液體活檢樣本無標(biāo)記分析工具。相關(guān)研究成果以“Label-free detection and enumeration of rare circulating tumor cells by bright-field image cytometry and multi-frame image correlation analysis”為題發(fā)表于Lab on a chip期刊,其中碩士生杜自強(qiáng)和鄭大一附院李婭副主任醫(yī)師、陳冰助理研究員為論文共同第一作者,張文昌副研究員和楊瀟楠教授為共同通信作者。

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為了實(shí)現(xiàn)高檢測通量和檢測精度,研究人員提出了BFIC(圖1),并設(shè)計(jì)了一種具有長直通道(400μm × 30μm × 600μm)的微流控器件來引導(dǎo)細(xì)胞以層流方式通過。由于400μm的通道寬度遠(yuǎn)大于腫瘤細(xì)胞的大小,因此細(xì)胞可以平行通過,與單通道方法相比,可實(shí)現(xiàn)更高的通量和無堵塞操作,其吞吐量可高達(dá)每分鐘5萬個(gè)細(xì)胞,如果使用更高速度的相機(jī)、更大的視野可以進(jìn)一步提高吞吐量。

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圖1 (a)明場成像細(xì)胞儀示意圖;(b)連續(xù)幀中細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)狀態(tài);(c)連續(xù)單幀中的細(xì)胞分類和定位;(d)多幀關(guān)聯(lián)和計(jì)數(shù)。


采集到的圖像被傳輸?shù)接?jì)算機(jī)上經(jīng)過訓(xùn)練的神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)YOLO-V4,結(jié)合每一幀的細(xì)胞類型和位置以及幀序列信息,得出細(xì)胞的初步分類決策(圖1(c))。接著,研究人員通過執(zhí)行基于細(xì)胞跟蹤的MFIC算法以提高檢測精度,如圖1(d)所示。根據(jù)YOLO-V4模型給出的細(xì)胞類型和坐標(biāo)信息,在細(xì)胞跟蹤算法下將細(xì)胞的多幀檢測結(jié)果關(guān)聯(lián)起來。

在具體試驗(yàn)過程中,為了對(duì)該方法進(jìn)行測試,研究人員選擇了三種類型的細(xì)胞系,包括結(jié)直腸腺癌細(xì)胞系的HT29、肺癌細(xì)胞系的A549和食管癌細(xì)胞系的KYSE30。獲得的紅細(xì)胞(RBCs)、白細(xì)胞(WBCs)和腫瘤細(xì)胞的圖像如圖2所示。

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圖2 (a-e)RBCs(a)、WBCs(b)、HT29(c)、A549(d)和KYSE30(e)的細(xì)胞圖像,比例尺:20μm;(f)檢測細(xì)胞的尺寸分布。

經(jīng)過訓(xùn)練,細(xì)胞檢測模型能夠給出分類決策以及位置坐標(biāo)。測試集上每一幀細(xì)胞的匯總結(jié)果如表1和表2所示。從表2可以看出,對(duì)于上述三種腫瘤細(xì)胞,單幀檢測的平均精度(AP)可以分別達(dá)到98.63%、99.04%和98.95%。

表1 測試集的混淆矩陣

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表2 YOLO-V4單幀檢測在測試集上的性能評(píng)價(jià)

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此外,為了定量比較單幀檢測與多幀相關(guān)檢測在識(shí)別效果方面的差異,研究人員采用了隨機(jī)單幀模式和連續(xù)5幀模式檢測每個(gè)細(xì)胞系的500個(gè)腫瘤細(xì)胞。如圖3(c)所示,連續(xù)幀中CTC的識(shí)別主要表現(xiàn)在以下三種情況:True——CTC在每一幀中都被正確識(shí)別;False——非CTC(背景或其他細(xì)胞)被錯(cuò)誤識(shí)別為CTC,表現(xiàn)出假陽性;Loss——CTC因在單個(gè)幀(例如WBC)中的錯(cuò)誤識(shí)別或因細(xì)胞粘附而漏檢而表現(xiàn)出假陰性。

在獲得每一幀的所有細(xì)胞類型后,為了模擬單幀的檢測結(jié)果(傳統(tǒng)的靜態(tài)細(xì)胞檢測),研究人員隨機(jī)地選擇每個(gè)細(xì)胞連續(xù)5幀中的一幀,匯總了500個(gè)細(xì)胞的隨機(jī)單幀結(jié)果后,得到一個(gè)“單幀AP值”。每個(gè)“單幀AP值”代表在單幀模式下執(zhí)行一次CTC檢測。這個(gè)過程重復(fù)了100次。圖3(d)、(f)和(h)分別顯示了100次隨機(jī)試驗(yàn)中HT29、A549和KYSE30的“單幀AP值”分布。

而在多幀數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)中,單個(gè)腫瘤細(xì)胞在連續(xù)幀中被正確識(shí)別的次數(shù)記為n(1≤n≤5)。然后,研究人員使用不同的n作為閾值,對(duì)跟蹤的腫瘤細(xì)胞進(jìn)行二次分類決策,作為多幀檢測結(jié)果。之后,參考AP的計(jì)算方法,研究人員計(jì)算了多幀關(guān)聯(lián)中不同閾值下的分類結(jié)果的AP。圖4(e)、(g)和(i)顯示了n值對(duì)三個(gè)細(xì)胞系A(chǔ)P值的影響。當(dāng)閾值n取非端點(diǎn)值時(shí),多幀檢測的AP與單幀檢測的平均AP相比有顯著提高。

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圖3 (a)連續(xù)幀的細(xì)胞圖像;(b)目標(biāo)細(xì)胞從Fn到Fn+x跟蹤過程示意圖;(c)連續(xù)幀中的CTC識(shí)別案例;(d)、(f)和(h)100次隨機(jī)試驗(yàn)中三種腫瘤細(xì)胞的“單幀AP值”分布;(e)、(g)和(i)閾值n對(duì)多幀關(guān)聯(lián)分析模式下三種腫瘤細(xì)胞AP值的影響。

大多數(shù)可用的CTC檢測技術(shù)依賴于CTC標(biāo)記物的標(biāo)記,例如上皮細(xì)胞粘附分子(EpCAM)和E-鈣黏蛋白(E-cadherin)。然而,這些上皮生物標(biāo)志物在上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)過程中會(huì)急劇減少,并會(huì)導(dǎo)致標(biāo)記信號(hào)的丟失。為了評(píng)估EMT對(duì)上述CTC檢測方法的影響,研究人員利用HT29細(xì)胞系對(duì)EMT前后的腫瘤細(xì)胞進(jìn)行了檢測。圖4(d)和(e)的數(shù)據(jù)表明,基于明場動(dòng)態(tài)顯微成像與多幀關(guān)聯(lián)算法的無標(biāo)記循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測方法在EMT后對(duì)CTC的平均識(shí)別精度為98.8%。因此,與依賴細(xì)胞表面特異性抗原表達(dá)的基于標(biāo)記的檢測技術(shù)相比,該無標(biāo)記檢測方法具有很大的優(yōu)勢,突破了僅適用于對(duì)上皮來源的CTC篩選的局限性。

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圖4 (a)PMA誘導(dǎo)的HT29細(xì)胞形態(tài)和分子表達(dá)變化;(b)通過蛋白質(zhì)印跡分析評(píng)估E-鈣粘蛋白和N-鈣粘蛋白的表達(dá);(c)HT29(EMT后)懸浮成像示意圖;(d)HT29(EMT后)在100次隨機(jī)試驗(yàn)中的AP分布柱狀圖;(e)多幀關(guān)聯(lián)模式下不同閾值下的AP分布。

最后,為了評(píng)估該檢測系統(tǒng)的性能,研究人員評(píng)估了其檢測限(LoD)。圖5(a)顯示了通過該細(xì)胞計(jì)數(shù)法檢測到的樣品中HT29細(xì)胞數(shù)與顯微鏡檢測到的HT29細(xì)胞數(shù)之間的關(guān)系。值得注意的是,該系統(tǒng)檢測到的HT29細(xì)胞與顯微鏡檢查之間存在極好的線性關(guān)系(R2>0.99)。這種一致性驗(yàn)證了該方法量化真實(shí)樣本中CTC數(shù)量的能力。同時(shí),在HT29的比例低至0.01%左右時(shí),曲線的線性度明顯下降。因而該方法的檢測限為每10萬個(gè)WBC檢測出10個(gè)CTC。

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圖5 (a)BFIC得到的檢出限示意圖;(b)從2例結(jié)直腸腺癌(CA)患者樣本、2例肺癌(LC)患者樣本、4例食管癌(EC)患者樣本和6例健康供體(對(duì)照)樣本中檢出的CTC數(shù)量;(c)患者樣本中CTC和WBC的細(xì)胞直徑。

綜上所述,在這項(xiàng)研究中,研究人員引入了一種基于明場動(dòng)態(tài)顯微成像與多幀關(guān)聯(lián)算法的無標(biāo)記循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測方法。通過記錄微流控芯片中寬通道內(nèi)的細(xì)胞圖像,并通過深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)確定細(xì)胞類型,達(dá)到了50000個(gè)細(xì)胞/分鐘的檢測通量,并避免了通道的堵塞。通過多幀相關(guān)分析,糾正了單幀中錯(cuò)誤或遺漏的細(xì)胞分類結(jié)果,在不同種類的腫瘤細(xì)胞系(HT29、A549、KYSE30)的檢測中分別達(dá)到了高達(dá)99.40%、99.52%以及99.47%的AP。該檢測方法能夠較容易地從10萬個(gè)白細(xì)胞中檢測到多達(dá)10個(gè)腫瘤細(xì)胞,并且不受EMT的影響。另外,該方法也在8例癌癥患者的血液樣品中完成了驗(yàn)證,具有良好的臨床應(yīng)用潛力。

論文鏈接:

https://doi.org/10.1039/D2LC00190J

審核編輯 :李倩

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原文標(biāo)題:基于明場動(dòng)態(tài)顯微成像與多幀關(guān)聯(lián)算法的無標(biāo)記循環(huán)腫瘤細(xì)胞檢測方法

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