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各種研究結(jié)果不斷證明,人類各種常見(jiàn)疾病都屬于復(fù)雜疾病,是由多基因、多因素、遺傳和環(huán)境共同作用的結(jié)果。借助于高通量生物技術(shù)的飛速發(fā)展,生物學(xué)家建立起了蛋白交互網(wǎng)絡(luò),如果借助復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)研究的方法,從這些網(wǎng)絡(luò)中找出與疾病相關(guān)的蛋白質(zhì)子網(wǎng)絡(luò),將有助于我們更深入地了解生物體的運(yùn)作機(jī)制。本文提出了一種基于貪婪算法的搜索方法,能夠自動(dòng)地搜索整個(gè)網(wǎng)絡(luò)中的子網(wǎng)或模塊,并且能夠結(jié)合芯片數(shù)據(jù)同時(shí)進(jìn)行T檢驗(yàn)來(lái)判斷子網(wǎng)絡(luò)對(duì)疾病表型的區(qū)分能力。通過(guò)計(jì)算子網(wǎng)的P值,給出該蛋白質(zhì)子網(wǎng)絡(luò)的統(tǒng)計(jì)顯著性值并進(jìn)行區(qū)分能力排序。運(yùn)行結(jié)果表明,本方法不但能夠用于發(fā)現(xiàn)已知的疾病蛋白,而且能夠?qū)ξ粗牡鞍走M(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)合生物芯片技術(shù),將會(huì)對(duì)疾病基因的研究提供有價(jià)值的信息。
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